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收藏| 重医谢鹏团队开发新型抑郁症相关代谢物疾病数据库:MENDA
  
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  脑科学新闻2019.7.28我要分享

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  本文转载自:解螺旋(HelixLife)

  抑郁症是全球健康不良和残疾的主要原因,目前有3亿多抑郁症患者,其终生患病率为20%。尽管人们提出了各种抑郁症的理论,但对抑郁症的分子机制仍知之甚少。代谢物作为基因、转录本和蛋白质分子相互作用的最终产物,在生物体中发挥着重要的生物学作用。代谢异常在抑郁症患者和动物模型中被广泛报道。

  近几十年来,随着系统生物学、代谢组学技术的快速发展,核磁共振、气相色谱-质谱和液相色谱-质谱技术已被广泛应用于抑郁症的代谢特征鉴定以及血浆、尿液、脑脊液中抗抑郁药物的监测。然而目前抑郁相关的代谢特征仍然没有被系统的整合。

  2019年6月3日重庆医科大学谢鹏教授在Briefings in bioinformatics(IF:9.101)开发了一款新的抑郁症相关代谢物疾病关联数据库MENDA。

  MENDA数据库链接:

  image.php?url=0MkuNRSfru

  1

  MENDA数据库基本介绍

目:

  image.php?url=0MkuNRRpnn

目来自非人类灵长类动物。

  病人包括抑郁患者、老年人抑郁症与中风后抑郁等,抑郁动物模型包括慢性温和应激抑郁模型(Chronic mild stress, CMS模型)、社会挫败模型(Social defeat stress, SDS模型)、慢性束缚应激模型(Chronic restraint stress, CRS模型)、习得性无助模型(learned helplessness, LH模型)、脂多糖模型(lipopolysaccharide, 目组织来源包括:脑、脑脊液与脊髓在内的中枢系统与血液、尿液、肝脏等。

  image.php?url=0MkuNRHDix

  2

  MENDA数据库功能

  About界面Introduction包含MENDA数据库的介绍:

  image.php?url=0MkuNRbmZz

  研究类型包括以下五类研究:

  image.php?url=0MkuNRqLbs

  Browse界面下包括一般水平信息(The general level information)、代谢物水平信(The metabolite level information)、研究水平信息(The study level information)等:

  image.php?url=0MkuNR8Ysa

  The general level information:

目与文献数量:

  image.php?url=0MkuNRi4kK

  可进一步查看CMS模型包含327个差异代谢物,以及对应的参考文献,例如LysoPC来自文献457:

  image.php?url=0MkuNRZomF

  image.php?url=0MkuNR5F8N

  image.php?url=0MkuNRGccU

  还可以查看文献457涉及的所有差异代谢物:

  image.php?url=0MkuNRw5xj

  MENDA数据库查询,输入查询代谢物Glyceric acid:

  image.php?url=0MkuNR15DF

  结果显示有7篇研究涉及Glyceric acid,点击任意相关Study即可查看该文献相关内容:

  image.php?url=0MkuNRsnuR

  image.php?url=0MkuNRM8GQ

  Glyceric acid与抑郁症的关系及在不同研究中组织与器官中的变化:

  image.php?url=0MkuNRfooj

件进行高级搜索:

  image.php?url=0MkuNRnXro

件的结果仅有5篇研究:

  image.php?url=0MkuNRUwat

  MENDA数据库是第一个特定神经精神病学疾病的代谢数据库,对抑郁症研究者非常有价值,希望对大家有所帮助!

  参考文献:

  Pu J, Yu Y, Liu Y, et al. MENDA: a comprehensive curated resource of metabolic characterization in depression. Brief Bioinform. 2019

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